بررسی روابط فیلوژنتیکی برخی از جدایه های قارچ fusarium graminearum با استفاده از آنالیز توالی ژن mating type در ایران

thesis
abstract

در این مطالعه از توالی ژن های mating type و histone h3 جهت بررسی روابط فیلوژنتیکی گونه های قارچ fusarium graminearum sensu lato جدا شده از نمونه خاک های مناطق مختلف جغرافیایی ایران شامل نواحی شمالی، نواحی جنوبی و نواحی شمال غربی استفاده شده است. برای تکثیر نواحی mating type از آغازگرهای m12-2/m12-3 و m21-1/m21-2 و برای تکثیر ژن histone h3 از آغازگرهای h3f1/h3r1 استفاده شد. قطعات تکثیر شده توالی یابی شدند. توالی ها با استفاده از نرم افزار clustal w همردیف شدند و سپس با استفاده از نرم افزار mega 4 مورد تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی قرار گرفتند. درخت فیلوژنی با استفاده از سه متد maximum parsimony (mp)، minimum evolution (me) و neighbor-joining (nj) و توالی ژن های فوق در گونه f. pseudograminearum به عنوان برون گروه ترسیم گردید. درخت بدست آمده از توالی ژن های mat1-1-2 و histone h3 جدایه های مورد بررسی را به چهار گروه متفاوت و درخت بدست آمده از توالی ژن mat1-2-1 جدایه های مورد بررسی را به سه گروه متفاوت تقسیم کردند. این نتایج نشان داد که جدایه های مورد آزمایش دارای تنوع ژنتیکی هستند. همچنین اقدام به همردیف سازی توالی های بدست آمده با توالی های استاندارد موجود در بانک ژن ncbi شد که نتایج بدست آمده نشان داد تمام جدایه های مورد بررسی به گونه f. graminearum sensu strico تعلق دارند.

Already have an account?login

similar resources

بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های قارچ Fusarium verticillioides (Sacc.) Nirenberg، عامل پوسیدگی بلال ذرت با استفاده از نشانگرهای AFLP

تعداد 108 جدایه قارچ Fusarium verticillioided عامل بیماری پوسیدگی فوزاریومی بلال ذرت که از نمونه های به دست آمده از مناطق مختلف جغرافیایی و ذرت خیر ایران در سال 1384 جداسازی شده بودند به همراه دو جدایه استاندارد این قارچ از آفریقای جنوبی با استفاده از نشانگرهای AFLP ارزیابی شدند. پس از استخراج DNA جدایه ها، از آنزیم های برشی EcoRI و MseI برای برش استفاده شد و قطعات برش یافته به آداپتورهای دو رش...

full text

مطالعه فیلوژنی جدایه های Theileria annulata از استان البرز با استفاده از توالی ژن های 18S rRNA و ITS1-2

تیلریوز گرمسیری بیماری انگلی ناشی از تک یاخته T.annulata بوده و بوسیله کنه های جنس هیالوما منتقل می شود. تشخیص بیماری معمولاً با مشاهده انگل در گسترش های خون محیطی، طحال و غدد  لنفاوی صورت می گیرد.  امروزه روش  های ملکولی با حساسیت و ویژگی بالائی به منظور تشخیص و شناسائی عامل بیماری در دام های مبتلا و ناقل، مطالعات همه گیری شناسی  و بررسی های فیلوژنی مورد استفاده قرار می گیرد.  با توجه به حضور ت...

full text

شناسایی 30 جدایه قارچ Metarhizium با استفاده از توالی ITS1-5/8S-ITS2

Metarhizium spp قارچبیمارگریاستکهدرکنترلزیستیطیف وسیعیازآفتهانقشداردوبرپایهویژگیهایتبارشناختی وملکولیشناساییمیگردد. توالیهایITS و5/ S8 ریبوزومی، برایشناساییگونههاوسویههای 30 جدایهیجمعآوریشده ازخاکهای شاهرودوشمالایرانبههمراه 10 توالیازگونه هایشناختهشدهبرایرسمدرختتبارشناختیمتارایزیومبه کاربردهشدند. صفاتنرخرشد،زهرآگینیوتعدادکنیدیهای تولیدیجدایههارویمحیطکشتPDA حاویقارچکشهای انتخابیاندازهگیریشدند. س...

full text

بررسی روابط فیلوژنتیکی برخی قارچ های ناقص

قارچ های ناقص، گروهی بحث برانگیز در میان قارچ ها هستندکه معیار های رده بندی آنها در طول سالیان، دستخوش تغییرات فراوان بوده است. در این تحقیق که به منظور بررسی روابط فیلوژنتیکی برخی قارچ های ناقص انجام شده است، نمونه هایی از بافت های گیاهی و خاک های چندین استان کشور جمع آوری و با معیارهای ذکر شده توسط الیس (1971) شناسایی گردید. از بین 81 جدایه به دست آمده، 48 جدایه فرم های غیر جنسی cochliobolus ...

شناسایی روابط فیلوژنتیکی گندم های زراعی و اجداد آن بر اساس توالی یابی ژن (HKT)

شوری یکی از مشکلات مهم در اراضی کشاورزی دنیا می‌باشد، به طوری که سالانه میلیون‌ها تن نمک از طریق آبیاری وارد خاک‌های زراعی می‌شود. گندم اولین و مهمترین گیاه زراعی دنیا است که غذای اصلی بیش از یک سوم مردم جهان را تأمین می‌کند. روش های نوین ژنتیکی همچون توالی‌یابی امکان ارزیابی دقیق و سریع مواد ژنتیکی در سطح DNA و RNA را فراهم نموده است. لذا به منظور شناسایی تنوع آللی ژن HKT از گونه‌های زراعی و و...

full text

شناسائی جدایه های قارچ Fusarium moniliforme عامل بیماری پوسیدگی طوقه برنج با استفاده از مارکرهای مولکولی RAPD

در این بررسی ضمن جمع آوری 58 جدایه قارچ Fusarium moniliforme عامل بیماری پوسیدگی طوقه برنج، مشخصات مرفولوژیکی و بیماریزایی آن‌‌‌ها روی گیاه برنج در آزمایشگاه و گلخانه در مرکز تحقیقات بین المللی برنج (IRRI) مورد مطالعه قرار گرفت. بعلاوه با استفاده از روش( RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA به کمک پرایمر 11-J از کیت Operon با تواتر 5ACTCCTGCGA-3 قسمت‌های تصادفی از DNA هر جدایه تکثیر گردید. سپس...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


document type: thesis

دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره) - قزوین - دانشکده فنی

Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023